党政办公室、机关党委(合署办公)
党委组织部（党校）、党委统战部（合署办公）
党委宣传部、新闻中心(合署办公)
党委教师工作部、人力资源部（合署办公）
党委学生工作部、学生工作处、党委人民武装部(合署办公)
党委巡察工作办公室
纪委办公室、监察处（合署办公）
发展和改革办公室、发展规划处（合署办公）
研究生院（校学位委员会办公室）
招生就业处
教务处
科研部
科技成果转移转化办公室
国际合作与交流部(含港澳台办公室)、国际学院(合署办公)
对外联络与基金事务处(含教育基金会秘书处,校友总会秘书处)
离退休干部工作处
财务处
资产与后勤保障处
基本建设处
保卫与校园管理处
团委
工会
保密办公室
图书馆
网络信息中心
档案文博院（档案馆 校史馆 博物馆）
出版社
校医院
中科大资产经营有限责任公司
附属中学
饮食服务集团
幼儿园
